Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GAPVD1Q14C86 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GAPVD1Q14C86 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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