Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPRHQ149N8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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