Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CHD4Q14839 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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