Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms