Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms