Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSC3Q14574 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms