Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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