Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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