Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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