Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TOP3AQ13472 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TOP3AQ13472 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TOP3AQ13472 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TOP3AQ13472 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TOP3AQ13472 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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