Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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