Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACACAQ13085 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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