Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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