Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNIP1Q12981 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP1Q12981 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP1Q12981 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP1Q12981 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP1Q12981 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP1Q12981 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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