Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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