Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms