Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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