Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms