Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms