Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms