Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms