Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNB3Q05901 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms