Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms