Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 694.4 ms