Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms