Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UFM1P61960 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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