Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms