Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms