Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms