Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCBP4P57723 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms