Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A2P55011 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms