Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSCP53634 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSCP53634 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSCP53634 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSCP53634 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSCP53634 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSCP53634 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSCP53634 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSCP53634 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSCP53634 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSCP53634 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms