Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2A2P52657 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms