Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms