Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PIP4K2AP48426 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PIP4K2AP48426 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIP4K2AP48426 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIP4K2AP48426 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PIP4K2AP48426 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIP4K2AP48426 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIP4K2AP48426 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIP4K2AP48426 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms