Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ME1P48163 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ME1P48163 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms