Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP5P45974 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP5P45974 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
USP5P45974 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP5P45974 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP5P45974 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms