Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSFMP43897 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSFMP43897 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSFMP43897 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TSFMP43897 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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