Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms