Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP2P42575 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms