Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4AP40617 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms