Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL9P32969 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL9P32969 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL9P32969 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL9P32969 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms