Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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