Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TSPOP30536 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TSPOP30536 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TSPOP30536 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TSPOP30536 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TSPOP30536 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms