Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBL1P28749 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBL1P28749 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBL1P28749 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms