Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms