Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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