Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms