Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
IFITM1P13164 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms