Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F5P12259 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F5P12259 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F5P12259 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms